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单细胞测序

10X 单细胞 ATAC

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scATAC-Seq—解密单个细胞内染色质可及性

  • 10× Genomics 单细胞 ATAC（scATAC-seq） 可同时满足表观遗传学研究与高通量细胞捕获的需求、在单细胞水平揭示细胞核内染色质可及性的差异，推测染色质调控活性，进一步分析可以预测转录因子结合位点，深入研究基因调控网络， 还能够鉴定细胞类型特异的转录因子，疾病发生等 重要生物学过程中揭示细胞在表观遗传学上的差异与动态变化，从而在系统发育。

  • 高效：

    10x Genomics 单细胞ATAC测序平台利用微流控和 barcode 标记等技术。捕获近十万个细胞，从而获得大量的表观遗传 信息。该过程通量高、成本低、周期短。

  • 准确：

    在单细胞水平揭示细胞核内染色质可及性的差异，揭示细胞在表观遗传学上的差异与动态变化。

应用方向

干细胞和发育生物学
神经系统发育研究
肿瘤异质性研究
发育轨迹研究

九游j9登陆 优势

  • 1. 平台齐全

    10x Genomics ·BD Rhapsody ·NanoString

  • 2. 样本制备多样化

    单细胞悬液制备 · 单细胞组织抽核
    植物原生质体制备 · 空间样本制备

  • 3. 便捷服务模式

    寄送服务（天津、北京、广州） · 实验员上门服务。

  • 4. 多组学联合方案

    单细胞转录组 + 免疫组
    单细胞转录组 + 蛋白组
    单细胞转录组 + 表观组 · 单细胞转录组 + 空间转录组

  • 5. 全面质控流程

    从样本制备、捕获建库、测序分析，全方位质控流程

信息分析

10× Genomics 单细胞ATAC 产品同时满足了表观遗传学研究与高通量细胞捕获的需求，深入研究基因调控网络，推测染色质调控活性，疾病发生等重要生物学过程中揭示细胞在表观遗传学上的差异与动态变化，同时还能够鉴定细胞类型特异的转 录因子，进一步的分析可以预测转录因子结合位点，从而在系统发育，可以在单细胞水平揭示细胞核内染色质可及性的差异。

送样建议

新鲜/速冻组织 组织大小＞0.2g
单细胞悬液 >80%，（尽量去除细胞团 / 碎片 / 杂质等）
细胞总量建议 30 万

常见问题

  • 1.为什么选择单细胞ATAC测序技术？

    • 同一类型细胞中可能存在很多不同表型及基因型的细胞，单细胞扩增技术通过在单个细胞水平上对基因组进行测序，为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系 等提供了新方向，广泛应用于：生殖细胞、胚胎干细胞、神经细胞、肿瘤细胞、免疫细胞等热点研究领域。

  • 2.对于10X scATAC的样本要求？

    • （1）物种要求：人、小鼠、其他物种要求有较高质量的基因组；
      （2）细胞类型要求：能够制备成高质量单细胞核悬液的类型；
      （3）起始的单细胞悬液，建议同10X 单细胞 RNA。采用活细胞，细胞活性>80%，细胞浓度700~1200 cells/μL，细胞总量可达30万个；
      （4）细胞核抽提质量要求：活细胞比例<5%（台盼蓝等染色可观测）；显微镜下，细胞核形态完整；尽量去除细胞碎片和细胞团。

  • 3.单细胞核悬液制备如何抽核？

    • （1）九游j9登陆提供10X scATAC 抽核服务，请联系销售预约；
      （2）客户自行抽核，九游j9登陆 提供资料和经验参考。

  • 4.单细胞核悬液质检标准？

    • 要做全基因组甲基化分析
      （1）细胞活性<5%（台盼蓝等染料检测）；
      （2）无碎片和细胞团；
      （3）显微镜下核形态完整。

  • 5.染色后的核是否可进行10X scATAC？

    • 不可以！结合 DNA 的染料会影响细胞核内的 DNA 构象， 导致10X scATAC测序不准确。

  • 6.10X scATAC和10X scRNA如何联合使用？

    • 细胞量足够的情况下，另一部分抽核后进行10X scATAC，一份单细胞悬液可以分成两份，一部分进行10X scRNA。不是一个细胞同时做 ATAC 以及 mRNA、这里和10X 5’转录组 +VDJ 不同，请注意区分， 而是同一群细 胞。

拓展材料

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