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群体进化

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解析种群信息，揭示群体进化历程

群体进化研究是指通过全基因组重测序技术获得某物种自然群体各亚群的基因组信息。从而从分子层面深入研究该物种的进化历程，讨论群体的遗传结构、基因交流情况、物种形成机制以及群体进化动态等生 物学问题，得到大量高准确性的SNP、InDel、SV、CNV等变异信息，通 过与参考基因组比对，然后基于群 体变异信息。

九游j9登陆 优势

  • 1.基于全基因组重测序的群体进化研究

    基于全基因组重测序的群体进化研究、挖掘进化基因，已广泛 应用于许多物种的人工驯化机制研究、自然选择机制分析和种群历史研究，可用来追溯群体的进化过程，能够有效地挖掘出群体内的遗传变异。具有重要的科学理论和实践应用价值。

    • 60天

      项目周期

    • 40+

      发表文章

    • 10+

      平均IF

  • 2.三代测序辅助SV-群体研究

    三代群体研究是利用三代重测序技术获得群体的结构变异信息，讨论群体间的遗传多样性、进化动态及物种形成机制等生物学问题。

    • 120天＋

      项目周期

    • 10 kb起

      测序读长

    • SV-群体

      分析内容

  • 3.科学方案设计

    从材料选取，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果，建库测序。

    材料选取

    DNA样品
    二代≥1.0μg
    三代≥10μg

    文库构建
    二代350bp
    三代≥10kb

    测序
    二代Illumina PE150
    三代Pacbio或Nanopore

    信息分析

  • 4.出色完成每一个项目环节

    至2019年8月。文章多发表于Nature Genetics、Nature Communications等国际知名期刊，九游j9登陆已完成藏猪、金丝猴、绵羊、西域飞蝗、桃子、小麦等几十个物种的群体进化研究。

    • 50人

      分析团队

    • 10年

      项目经验

    • 1500+

      结题项目

    • 1对1

      项目服务

信息分析

九游j9登陆WGBS基于全基因组水平，实现高效分析DMR及相关基因的功能分析，实现单碱基分辨率的甲基化位点准确定位，快速准确找到差异位点。
全基因组重测序（三代＋二代WGS） 全基因组重测序（WGS） 简化基因组测序（GBS） 简化基因组测序（RAD）
1. 已有参考基因组序列的动植物自然群体；
2. 样本间存在明显的亚群分化（如生殖隔离等）。
≥200个样本（WGS）；
挑选至少10个代表性个体做三代		 ≥200个样本
三代（Pacbio&Nanopore）：≥30X
二代（WGS）：≥10X		 基于SNP：≥10 X/个体
基于CNV：≥30X/个体		 10~20W Tags平均8 X/Tag 测序深度≥1X
测序数据质量评估
与参考基因组比对
SNP、CNV、SV检测及注释 SNP、CNV检测及注释 SNP检测及注释
差异SV分析
群体SV分型
构建系统进化树
群体主成分分析
遗传多样性分析
选择消除分析
基因功能注释与富集分析		 群体结构分析
遗传多样性分析
选择消除分析
基因功能注释与富集分析
种群历史分析
基因交流分析		 构建系统进化树
群体主成分分析
群体结构分析
遗传多样性分析

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售后服务可联系侧边栏"在线客服"、电话400-6581585，或发送邮件至 service@novogene.com

前台 :：023-87236768

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