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16S、18S、ITS等扩增子测序（二代）

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16S、18S、ITS等扩增子测序（二代） 一步到位检测环境微生物多样性

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域、
通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。

应用方向

医学领域：疾病与人体微生物间关系，如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等
环境领域：某一特定环境（雾霾、沙尘等污染环境，住宅、商场等生活环境）的微生物群落组成，有机肥发酵处理、污水治理、石油降解、水体及海洋等微生物群落分布和组成等
畜牧领域：肠道、瘤胃等微生物与动物繁殖、生长发育、营养健康、免疫和疾病治疗等的互作关系
农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等
生物能源：特殊功能的菌株、工程菌的开发
特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究

九游j9登陆 优势

  • 1.读长长, 周期短, 性价比高

    采用 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高，速度更快，运行时间更短，周期最短可达10天

  • 2.科学方案设计

    从材料选取，建库测序，到数据分析， 每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果

    • 60人

      分析团队

    • 9年

      项目经验

    • 100000+

      结题项目

    • 1对1

      项目服务

信息分析

基于目标区域的测序，检测序列丰度，以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。除QIIME1流程外，九游j9登陆 还实现全流程QIIME2分析，QIIME2中的插件DADA2可以修正测序错误，注释更为精准，且提供了多种可交 互式图形系统展示，详细介绍见“QIIME2为你而来”
标准分析 解决问题
物种注释 物种注释及各物种丰度信息
α-多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
β-多样性分析 不同样本间的微生物群落
及各样本差异情况
多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种，
同时可以比较组内差异和组间差异
的大小，判断分组是否有意义
CCA分析 研究物种组成与环境因子间的关系
环境因子关联分析
VPA分析
功能预测 预测样本的功能组成

高级分析 解决问题
肠型分析 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗
贝叶斯网络图 判断微生物之间、微生物和环境、
代谢物间的依赖关系
Source Tracker 样本中微生物群落来源

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

样本类型 建议送样量 最低送样量
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 3g 0.5g
水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) 2张 1张
拭子 3个 1个
瘤胃液/发酵液/组织液(离心有明显沉淀) 3mL，沉淀1g 1mL，沉淀0.5g
粪便/肠道内容物 2g(小鼠 6 粒) 0.5g(小鼠 3 粒)
动物/人组织 1g 0.5g
血浆 3mL 1mL
鲜奶 20mL 8mL

常见问题

  • 1.16S测序哪个区域比较合适？

    • 九游j9登陆提供的几个测序区域来自文献调研、但是目前并没有研究表明哪个测序区域更好。有文章研究表明土壤样本、 并且可重复性强（PNAS. 2013. 110(16): 6548-6553.），可检测的物种多样性更丰富，16S V4区（515F-806R）比较适合做扩增子研究。

  • 2.若关注环境中的真核微生物多样性，ITS测序和18S测序哪个更好?

    • ITS测序主要是针对真菌多样性的研究，但是就真菌来说精确度相对较低；可根据研究目的合理选择测序方案，注释到的范围广，注释准确度高；18S测序针对的是真核微生物。

  • 3.扩增子与宏基因组的区别？

    • 扩增子主要分为16S、18S、ITS测序、关注环境样本中的物种组成，实用性高，该技术物美价廉。宏基因组关注环境样本中的物种组成、功能组成及代谢通路等信息，该技术深入挖掘环境样本功能层面的信息。

  • 4.样本送到公司，什么时候可以拿到结果？

    • 自样本检测合格之后开始计算周期，包括建库、测序、数据分析、结题。扩增子周期共计20个自然日。

更多内容，可扫描侧边栏"一对一业务咨询"二维码添加科研服务经理咨询。

售后服务可联系侧边栏"在线客服"、电话400-6581585，或发送邮件至 service@novogene.com

前台 :：027-89636801

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