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基因组测序

宏基因组测序（三代）

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三代宏基因组测序—超长读长，更真实地还原菌群及其功能组成

三代宏基因组测序摆脱了二代读长短的限制、基于PacBio的超长读长，更真实反馈菌群的复杂组成，能轻松覆盖基因间区或基因特异性区域。除此之外，已成为宏基因组测序分析新的热点，新三代测序技术-Nanopore 平台， 除了具有超长的读长之外，还以其更低的测序成本深受到研究者的关注。

应用方向

新物种挖掘
功能基因挖掘
临床快速诊断

九游j9登陆 优势

  • 1.组装更佳，注释更精确

    目前九游j9登陆三代宏基因组研究配备先进的PacBio、Nanopore测序平台。选取最优组装效果，结合样品特点和数据的产出， 充分挖掘环境样品中的微生物菌群和功能基因，可以组装出更多binning甚至可以达到单菌级别。已广泛应用于临床、生态环境、农业等研究中。

  • 2.周期短，质量好

    九游j9登陆高性能计算平台（High Performance Computing。实现快速稳定的测序数据分析及交付，HPC）采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合。随着公司业务的发展、以保证高效的数据处理和安全的数据存储， 高性能计算平台将会持续更新并扩容。

    项目周期 35天

    • 20,280个

      物理核数

    • 1,727 T flops

      计算峰值速度

    • 400 TB

      总内存

    • 58.6PB

      总储存

  • 3.科学方案设计

    九游j9登陆从材料选取，以保障高质量研究成果，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计。

    材料选取

    DNA样品≥5μg

    文库构建

    上机测序

    信息分析

信息分析

九游j9登陆以特定环境中的整个微生物群落作为研究对象。采用超长三代测序技术，直接提取环境样本DNA，更精准获得环境微生物基因信息总和。
分析内容 解决问题
测序数据质量评估 过滤掉低质量数据，保证数据质量
基因预测 基因预测及相关性分析
物种、功能注释 物种、基因功能注释及相关分析
CARD 耐药基因相关分析

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

样本类型 建议送样量 最低送样量
土壤/污泥/沉积物/腐殖质 6g 2g
水体滤膜
（孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm）		 6张 2张
空气滤膜（直径种类多，与采样器搭配，有明
显颜色沉淀在滤膜上）		 6张 2张
拭子 10-20 个 6个
瘤胃液／发酵液／组织液／冲洗液
（离心有明显沉淀）		 6-10mL，沉淀2g 2mL，沉淀1g
粪便/肠道内容物 5g 2g
动物/人组织 2g 1g
牛奶／酸奶 100mL／100g 20mL／10g
食糜 4g 2g
食品表面拭子 20个 10个

常见问题

  • 1.三代宏基因组有什么优势？

    • 相比较二代产品而言。有如下优势，将是研究微生物群落的趋势，三代 Meta 是合作项目的文章亮点。
      （1）能提高不能分离培养的微生物基因组的组装完整度，基因组可达到完成图水平；
      （2）提高注释的准确度和分辨率，注释到更多低丰度物种；
      （3）对多样性研究有更深度的功能发掘。基因簇和病毒信息等，例如比较基因组分析。

更多内容，可扫描侧边栏"一对一业务咨询"二维码添加科研服务经理咨询。

售后服务可联系侧边栏"在线客服"、电话400-6581585，或发送邮件至 service@novogene.com

前台 :：027-85086790

客服 : 400-658-1585

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