基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
转化医学>
转化医学及临床试验服务>
伴随诊断一站式解决方案>
多组学联合分析>
935K甲基化芯片—方便快捷的甲基化检测方法
芯片位点
技术优势
应用方向
肿瘤研究
肺癌、食管癌、卵巢癌等研究复杂疾病研究
精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等研究环境互作研究
吸烟、喝酒、工业暴露、污染等发育研究
胚胎发育、神经分化、细胞分化等九游j9登陆 优势
1.周期短
样本为8的倍数时,周期仅需30天!2.专业背景强
基于成熟的生物信息分析人才,进行专业的项目分析。3.科学方案设计
从材料选取、探针捕获、到检测分析。每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。检测原理
探针一:
对于每个位点都设计有两种探针。分别对应M型磁珠和U型磁珠。M 型磁珠尾部为 G。用来检测未甲基化位点,用来检测甲基化位点;U型磁珠尾部为 A。 基因组上的某一位点如果被甲基化了。那么在亚硫酸氢盐的处理下,与M 型磁珠配对,M 型磁珠发光,CG 仍为 CG,荧光标记的核苷酸掺入后能被检测到荧光信号。反之,延伸后U 型磁珠发光,如果没有被甲基化,那么在亚硫酸氢盐的处理下,CG 变为 TG,与 U型磁珠配对。探针二:
Infinium Ⅱ 探针只使用一种磁珠,配对后只掺入单个碱基,探针末端为 C。根据荧光类型判断掺入的碱基类型,即可判断是否被甲基化。信息分析
935K甲基化芯片可以进行DMP、DMR信息挖掘、并进行系列数据分析,助力高分文章发表。935K甲基化芯片 分析内容 | 1. 各样本的 β 值密度曲线图、箱线图和堆叠图 |
---|---|
2. 组间 β 值相关性散点图 | |
3. PCA 图 | |
4. 样本相关性热图 | |
5. 差异甲基化位点(DMP)列表 | |
6. DMP火山图、散点图、热图 | |
7. 高、低甲基化DMP及基因个数统计 | |
8. 不同区域DMP统计 | |
9. DMP的TSS区域分析 | |
10. DMP在染色体上的分布图和circos图 | |
11. 差异甲基化区域(DMR)列表 | |
12. DMR长度密度分布图 | |
13. DMP/DMR 相关基因的 GO 富集 | |
14. DMP/DMR 相关基因的 KEGG 富集 |
关联分析
通过DNA甲基化与基因表达进行关联分析。可以帮助我们了解DNA甲基化修饰与RNA表达是否存在相关性,样本中哪些基因的表达受到DNA甲基化修饰的影响以及对应基因的功能。因此935K甲基化芯片和转录组的联合分析广泛应用于疾病研究,生物性状等多种领域。935K甲基化芯片与mRNA关联分析 | 1.利用甲基化位点对应的基因和转录组数据对应的基因信息,进行关联分析绘制starburst散点图 |
---|---|
2.应用差异甲基化位点数据和转录组差异基因数据绘制甲基化与转录组相关的circos图 | |
3.利用935K甲基化芯片获得的DMR信息,与转录组检测获得的与DMR最接近的基因表达情况,进行甲基化与转录组的联合分析并绘制相关性热图 | |
4.根据转录组数据分别得出高、低表达的基因,分析转录组差异基因上对应的甲基化位点甲基化水平 |
送样建议
样本类型 | 送样建议 |
---|---|
组织样本 | ≧30mg;口腔拭子≧3份 |
FFPE |
推荐用试剂盒进行修复 15-20张切片(5-10μm厚,1×1 cm 2大小) |
基因组DNA | 总量≧500ng,浓度≥50 ng/μl |
细胞 | 1×106-1×107个 |
全血 | ≥0.5 ml |
唾液 | ≥4 ml |
常见问题
1. 怎样判断935K 芯片是否包含客户关心的位点?
2. 与850K 芯片相比,935K 芯片存在哪些优势呢?
3. 甲基化的差异分析支持无生物学重复吗?差异筛选的规则是什么?
4. 差异分析的时候,文件结果怎么看对照和处理的差异?
更多内容,可扫描侧边栏"一对一业务咨询"二维码添加科研服务经理咨询。
售后服务可联系侧边栏"在线客服"、电话400-6581585,或发送邮件至 service@novogene.com
Copyright@2011-2023 All Rights Reserved 版权所有:九游j9登陆 京ICP备15007085号-1
");
let title = html.substr(tit_startIndex + 7, tit_endIndex - tit_startIndex - 7)
document.title = title
//修改右侧href
$(".content-right").find(".contentTab a").each(function () {
var href = $(this).attr("href");
if (href.indexOf("addTabRightUrl") < 0) {
href = "javascript:addTabRightUrl('" + href + "')";
$(this).attr("href", href);
}
});
$(".content-right").find(".contentTab select").each(function () {
$(this).attr("onchange", "addTabRightUrl(options[selectedIndex].value)");
});
Fflc_Style() /*20220610 添加的*/
TuPianFangDa()
MaoDianDingWei();
return;
})
}
//点击右侧切换效果
function addTabRightUrl(url, tzlx) {
if (tzlx != null && tzlx != undefined && tzlx != "") {
if (tzlx == "bhleftdh") {
window.open(url,"_blank");
return;
}
}
$.get(url, function (data) {
var html = "";
if (data == undefined || data == null || data.length < 1) { html = ""; return; }
html = data;
var startIndex = html.indexOf("");
var endIndex = html.indexOf("
");
$("code").html(html.substr(startIndex + 6, endIndex - startIndex - 6));
$(".banner").html($(html).find(".banner").html());
$(".linkurl").html($(html).find(".linkurl").html());
$(".content-right").html($(html).find(".content-right").html());
//获取title
var tit_startIndex = html.indexOf("