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CRISPR Screen

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CRISPR Screen——高通量基因编辑筛选手段

  • CRISPR Screen检测：

    基于CRISPR/Cas9技术，识别与特定表型相关的基因，在全基因组范围内进行基因编辑实验，筛选出大量突变细胞，通过高通量测序技术，比较每一组sgRNA变化情况，并按照从大到小进行排序，为研究打靶基因提供有力的武器，设计成千上万个sgRNA，统计每一种sgRNA reads富集数。检测全面。专业背景强，精准分析。

应用方向

  • 文库筛选

    可进行全基因组规模的文库筛选，对某类功能相关的基因编辑的筛选。

  • 队列研究

    疾病与风险因素、遗传特征等研究。

  • 癌症疾病

    肿瘤、免疫病等研究。探究肿瘤进化机制、寻找肿瘤治疗靶标、高效探索药物机制、开发联合用药等。

  • 动植物研究

    性状筛选。

九游j9登陆 优势

  • 1. 生信分析内容丰富

    基于成熟的生物信息分析人才，专业的项目分析，可以根据客户不同要求分析个性化内容，对每一个sgRNA进行全面扫描，准确的定位分析。

  • 2.物种经验丰富

    九游j9登陆不仅对人、在如猪、弓形虫等生物中也有经验！助力客户发表更高分的文章，小鼠等常规物种有大量的项目经验，大鼠。

  • 3.科学方案设计

    从建库测序、每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果，到数据分析。

PCR产物
（1.5μg）

文库构建

测序
（PE150）

生物信息分析

信息分析

九游j9登陆基于对应用文库及选择机制后的细胞系进行二代测序，获得与选择机制相关的基因，并对不同组的sgRNA富集数进行比对分析，分析统计每一种sgRNA reads的富集数。
产品 分析内容
CRISPR Screen (sgRNA library) 检测 1. 原始序列数据
2. 测序数据质量评估：去除低质量和接头污染数据
3. 与参考序列进行比对、统计覆盖度和测序深度
4. 统计每一种 sgRNA 对应 reads 支持数
5. 对 sgRNA reads 富集数进行标准化调整，绘制箱线图
6. 聚类热图

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

仅接受纯化后的PCR产物或客户自建库

常见问题

  • 1.怎样推荐检测数据量?

    • 建议10,000条 sgRNA 测1Gb 的数据量。

  • 2.样本要求是什么?

    • 要求老师提供纯化后的 PCR 产物，避免设计在 PCR 产物中间位置，片段在250~280 bp最佳，靶位点尽量靠近左端或右端引物。

  • 3.测序平台和测序策略?

    • CRISPR Screen 的测序平台是 Illumina，测序策略为 PE150。

  • 4.为什么一对引物可以扩增出所有的 sgRNA ?

    • 根据通用载体sgRNA上下游的序列进行引物设计，所以可以扩增出所有转入细胞系中 sgRNA。

拓展材料

更多内容，可扫描侧边栏"一对一业务咨询"二维码添加科研服务经理咨询。

售后服务可联系侧边栏"在线客服"、电话400-6581585，或发送邮件至 service@novogene.com

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