基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
转化医学>
转化医学及临床试验服务>
伴随诊断一站式解决方案>
多组学联合分析>
三代测序的碱基错误率是随机产生的,通过增加测序深度,能够迅速提升准确性(一般覆盖到10X以上,避免假阳性的同时,得到更加准确的变异位点和类型,正确率可以达到99.9%);无测序偏好性:可以最大程度上还原基因实际情况;三代reads平均读长为12kb,可以比较均匀的覆盖参考基因组,明确比对到相应区域。
提升复杂基因组组装指标
直接获得全长转录组信息
直接读取原始数据中DNA甲基化修饰信息
目前最新的 Pac bio Sequel Ⅱ 平台 CLR 模式单张芯片产出在 100-150 G 之间, CCS 模式产出大概在 250-300 G 之间,具体的产出与文库质量、文库大小相关。一般 de novo 项目文库类型为 CLR-20K、CLR40K、CCS-15K , CLR 模式平均读长在 10-20k , subreads N50长度在20-30K 之间 。CSS模式平均读长在10-15K,subreads N50长度在10-15K之间 。
CLR的插入片段长,对文库的测序 < 2 passes (从接头读到接头),这样的 reads 测序错误率等同于原始的测序错误率, 主要用于基因组 de novo 时的大片段文库测序、一般插入片段大小>15K;CCS的插入片段短,可用于全长转录组、全长16s、变异检测等较小片段文库测序,对文库的测序 ≥ 2 passes,一般插入片段大小在 10k左右,将相同的 subreads整合后产生的 CCS reads 准确率会有显著的提升。
目前 PromethION 平台单张芯片普通文库产出能稳定在 60G,最高可到 100G 以上。一般 de novo 项目文库下机数据的平均读长在 15-20K,read length N50 在 30-40K。对于 Ultra-long reads 文库,read length N50 更能达到 50K 以上,产出大概在 40G 左右,其平均读长可达到30-40K。
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