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mapping ratio分布统计

  • 将各个样本的筛选后reads与sgRNA文库序列进行比对，统计各个样本中比对上sgRNA 文库的reads数目的占比。
不同分组样本统计得到的 sgRNA 进行标准化调整，以箱线图的形式对比 case/control 组或不同处理组之间的 sgRNA 差异。

sgRNA read counts分布图

  • 对各样本的sgRNA read counts的分布进行作图，该图可展示样本间read counts分布的差异，sgRNA read counts 一般遵循泊松分布。

差异基因富集分析

  • 根据 sgRNA 富集的 reads 支持数差异筛选出候选基因后，富集分析研究候选基因在 Gene Ontology 中的分布状况以期阐明实验中样本在候选基因功能上的体现。差异基因 GO 富集柱状图，直观的反映出在生物过程（BP）、分子功能（MF）和细胞组分（CC）富集的 GO term 上差异 sgRNA 基因的个数分布情况。

前台 :：022-89264749

客服 : 400-658-1585

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